Prova, det kommer att fungera utan någon metadata. Jag har använt den metoden flera gånger för AVCHD, VOB-filer, MXF-filer, mm och kan garantera att det fungerar lika bra på dina filer. Du kan kasta filerna med metadata, du kommer aldrig att behöva dom då du inte längre har kvar mappstrukturen som filerna kommer ifrån.
Så här ser min formel ut:
1. Tryck WIN+R
2. Skriv cmd och tryck Enter
3. Navigera fram till mappen där dina filer ligger
4. Skriv copy Fil_A.m2ts /b + Fil_B.m2ts /b DenNyaFilen.m2ts
5. Tryck Enter
6. Vänta tills allt är klart. (Det tar en stund innan det är klart.)
Gör du rätt kommer du nu ha tre filer, Fil_A.m2ts plus Fil_B.m2ts samt DenNyaFilen.m2ts som består av dom två andra filerna men som nu är ihopsatt till en (1) fil utan någon skarv i varken bild eller ljud vilket är det du eftersöker. :)
EDIT: Det finns massor med gratisprogram som gör just det jag beskrev ovan utan du behöver använda DOS-kommandon. Sök på join clips eller merge clips. (och glöm det där med metadata...)